Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RD3LP0DJH9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RD3LP0DJH9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms