Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX2-8O15522 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX2-8O15522 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX2-8O15522 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms