Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DXG7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DXG7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DXG7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DXG7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DXG7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DXG7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B4DXG7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DXG7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DXG7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DXG7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DXG7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DXG7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DXG7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DXG7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DXG7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DXG7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DXG7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DXG7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DXG7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DXG7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B4DXG7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DXG7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DXG7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DXG7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DXG7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DXG7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DXG7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DXG7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DXG7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DXG7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DXG7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DXG7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DXG7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DXG7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DXG7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DXG7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DXG7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DXG7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DXG7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DXG7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DXG7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DXG7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DXG7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DXG7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DXG7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DXG7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B4DXG7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DXG7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DXG7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DXG7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DXG7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DXG7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DXG7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DXG7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DXG7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DXG7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DXG7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DXG7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DXG7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B4DXG7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B4DXG7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DXG7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DXG7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DXG7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DXG7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DXG7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DXG7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DXG7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms