Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB2A8KAH6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB2A8KAH6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB2A8KAH6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms