Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN9

ANKUB1, Protein ANKUB1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKUB1A6NFN9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKUB1A6NFN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKUB1A6NFN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms