Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F8A0AVK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F8A0AVK6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms