Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NANOGP8Q6NSW7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms