Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF3P17036 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF3P17036 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms