Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms