Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC4Q8N9L1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC4Q8N9L1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms