Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKAG1P54619 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKAG1P54619 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms