Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRKAG1P54619 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRKAG1P54619 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PRKAG1P54619 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKAG1P54619 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKAG1P54619 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRKAG1P54619 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKAG1P54619 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRKAG1P54619 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PRKAG1P54619 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PRKAG1P54619 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRKAG1P54619 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRKAG1P54619 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKAG1P54619 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PRKAG1P54619 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKAG1P54619 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKAG1P54619 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKAG1P54619 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRKAG1P54619 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKAG1P54619 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRKAG1P54619 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKAG1P54619 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKAG1P54619 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKAG1P54619 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKAG1P54619 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKAG1P54619 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKAG1P54619 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKAG1P54619 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKAG1P54619 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKAG1P54619 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKAG1P54619 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKAG1P54619 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKAG1P54619 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAG1P54619 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKAG1P54619 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKAG1P54619 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKAG1P54619 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKAG1P54619 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKAG1P54619 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAG1P54619 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKAG1P54619 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKAG1P54619 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKAG1P54619 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAG1P54619 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKAG1P54619 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKAG1P54619 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAG1P54619 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKAG1P54619 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAG1P54619 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKAG1P54619 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKAG1P54619 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKAG1P54619 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKAG1P54619 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRKAG1P54619 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAG1P54619 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAG1P54619 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAG1P54619 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKAG1P54619 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKAG1P54619 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAG1P54619 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAG1P54619 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKAG1P54619 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKAG1P54619 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKAG1P54619 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKAG1P54619 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKAG1P54619 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKAG1P54619 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAG1P54619 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKAG1P54619 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKAG1P54619 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAG1P54619 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAG1P54619 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKAG1P54619 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRKAG1P54619 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAG1P54619 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKAG1P54619 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKAG1P54619 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKAG1P54619 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKAG1P54619 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKAG1P54619 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAG1P54619 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKAG1P54619 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKAG1P54619 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKAG1P54619 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKAG1P54619 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAG1P54619 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAG1P54619 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAG1P54619 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKAG1P54619 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAG1P54619 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAG1P54619 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRKAG1P54619 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRKAG1P54619 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRKAG1P54619 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKAG1P54619 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAG1P54619 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKAG1P54619 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKAG1P54619 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKAG1P54619 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKAG1P54619 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms