Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 29.2
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PRPF8Q6P2Q9 RAI1-206ENST00000583166 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.92□□□□□ -0.182e-22■■■■■ 29.1
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PRPF8Q6P2Q9 TM9SF1-208ENST00000529332 2107 ntTSL 512.15□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 29.1
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PRPF8Q6P2Q9 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 29.1
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