RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523961.5

CCNC-216, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 5

Gene CCNC, Length 1,152 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-216ENST00000523961 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.27■■■□□ 2.44
CCNC-216ENST00000523961 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNC-216ENST00000523961 ABCC9O60706 1549 aa26.25■■□□□ 1.79
CCNC-216ENST00000523961 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNC-216ENST00000523961 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNC-216ENST00000523961 NACADO15069 1562 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNC-216ENST00000523961 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CCNC-216ENST00000523961 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.15■■□□□ 1.62
CCNC-216ENST00000523961 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.06■■□□□ 1.6
CCNC-216ENST00000523961 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CCNC-216ENST00000523961 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.64■■□□□ 1.54
CCNC-216ENST00000523961 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
CCNC-216ENST00000523961 SCRIBQ14160 1630 aa24.51■■□□□ 1.51
CCNC-216ENST00000523961 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNC-216ENST00000523961 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.29■■□□□ 1.48
CCNC-216ENST00000523961 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNC-216ENST00000523961 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.86■■□□□ 1.41
CCNC-216ENST00000523961 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CCNC-216ENST00000523961 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.73■■□□□ 1.39
CCNC-216ENST00000523961 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.6■■□□□ 1.37
CCNC-216ENST00000523961 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CCNC-216ENST00000523961 SMARCA4P51532 1647 aa23.45■■□□□ 1.34
CCNC-216ENST00000523961 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.34■■□□□ 1.33
CCNC-216ENST00000523961 NCAPD3P42695 1498 aa23.33■■□□□ 1.33
CCNC-216ENST00000523961 SMARCA2P51531 1590 aa23.32■■□□□ 1.32
CCNC-216ENST00000523961 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.31■■□□□ 1.32
CCNC-216ENST00000523961 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.23■■□□□ 1.31
CCNC-216ENST00000523961 HMGXB3Q12766 1538 aa23.21■■□□□ 1.31
CCNC-216ENST00000523961 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CCNC-216ENST00000523961 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CCNC-216ENST00000523961 WIZO95785 1651 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNC-216ENST00000523961 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CCNC-216ENST00000523961 NESP48681 1621 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNC-216ENST00000523961 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.69■■□□□ 1.22
CCNC-216ENST00000523961 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.66■■□□□ 1.22
CCNC-216ENST00000523961 ERCC6Q03468 1493 aa22.65■■□□□ 1.22
CCNC-216ENST00000523961 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNC-216ENST00000523961 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNC-216ENST00000523961 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNC-216ENST00000523961 CFTRP13569 1480 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNC-216ENST00000523961 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNC-216ENST00000523961 CUX2O14529 1486 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNC-216ENST00000523961 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNC-216ENST00000523961 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCNC-216ENST00000523961 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNC-216ENST00000523961 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.31■■□□□ 1.16
CCNC-216ENST00000523961 PRDM2Q13029 1718 aa22.3■■□□□ 1.16
CCNC-216ENST00000523961 WDR62O43379 1518 aa22.22■■□□□ 1.15
CCNC-216ENST00000523961 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CCNC-216ENST00000523961 ABCC8Q09428 1581 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNC-216ENST00000523961 TOPBP1Q92547 1522 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNC-216ENST00000523961 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22■■□□□ 1.11
CCNC-216ENST00000523961 IFT140Q96RY7 1462 aa21.9■■□□□ 1.1
CCNC-216ENST00000523961 CUX1P39880 1505 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNC-216ENST00000523961 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNC-216ENST00000523961 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.79■■□□□ 1.08
CCNC-216ENST00000523961 SOGA1O94964 1423 aa21.78■■□□□ 1.08
CCNC-216ENST00000523961 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
CCNC-216ENST00000523961 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCNC-216ENST00000523961 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCNC-216ENST00000523961 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.74■■□□□ 1.07
CCNC-216ENST00000523961 TOP2BQ02880 1626 aa21.69■■□□□ 1.06
CCNC-216ENST00000523961 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.68■■□□□ 1.06
CCNC-216ENST00000523961 SYNJ1O43426 1573 aa21.67■■□□□ 1.06
CCNC-216ENST00000523961 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCNC-216ENST00000523961 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
CCNC-216ENST00000523961 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.66■■□□□ 1.06
CCNC-216ENST00000523961 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CCNC-216ENST00000523961 WDR97A6NE52 1622 aa21.62■■□□□ 1.05
CCNC-216ENST00000523961 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.6■■□□□ 1.05
CCNC-216ENST00000523961 GRIN2BQ13224 1484 aa21.52■■□□□ 1.03
CCNC-216ENST00000523961 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.52■■□□□ 1.03
CCNC-216ENST00000523961 OSCARQ8IYS5 282 aa21.5■■□□□ 1.03
CCNC-216ENST00000523961 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.47■■□□□ 1.03
CCNC-216ENST00000523961 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.45■■□□□ 1.03
CCNC-216ENST00000523961 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
CCNC-216ENST00000523961 FBLN2P98095 1184 aa21.42■■□□□ 1.02
CCNC-216ENST00000523961 PBRM1Q86U86 1689 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNC-216ENST00000523961 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCNC-216ENST00000523961 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CCNC-216ENST00000523961 CHD1O14646 1710 aa21.37■■□□□ 1.01
CCNC-216ENST00000523961 SYNJ2O15056 1496 aa21.36■■□□□ 1.01
CCNC-216ENST00000523961 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.34■■□□□ 1.01
CCNC-216ENST00000523961 KIF27Q86VH2 1401 aa21.33■■□□□ 1.01
CCNC-216ENST00000523961 TRIM41Q8WV44 630 aa21.31■■□□□ 1
CCNC-216ENST00000523961 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.29■■□□□ 1
CCNC-216ENST00000523961 ADAMTS12P58397 1594 aa21.27■■□□□ 1
CCNC-216ENST00000523961 IGF1RP08069 1367 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNC-216ENST00000523961 GRIN2AQ12879 1464 aa21.22■□□□□ 0.99
CCNC-216ENST00000523961 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.16■□□□□ 0.98
CCNC-216ENST00000523961 CUL7Q14999 1698 aa21.14■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 NUP160Q12769 1436 aa21.13■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.11■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 ARHGEF11O15085 1522 aa21.11■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.1■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 CEP170Q5SW79 1584 aa21.09■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.08■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.08■□□□□ 0.97
CCNC-216ENST00000523961 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms