Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNA2P20248 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNA2P20248 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms