Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCNA2P20248 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCNA2P20248 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCNA2P20248 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCNA2P20248 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCNA2P20248 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCNA2P20248 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCNA2P20248 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CCNA2P20248 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCNA2P20248 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCNA2P20248 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCNA2P20248 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCNA2P20248 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCNA2P20248 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCNA2P20248 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCNA2P20248 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCNA2P20248 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCNA2P20248 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCNA2P20248 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCNA2P20248 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCNA2P20248 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCNA2P20248 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCNA2P20248 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNA2P20248 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNA2P20248 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCNA2P20248 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNA2P20248 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCNA2P20248 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCNA2P20248 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCNA2P20248 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCNA2P20248 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCNA2P20248 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCNA2P20248 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA2P20248 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA2P20248 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNA2P20248 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNA2P20248 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNA2P20248 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA2P20248 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNA2P20248 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNA2P20248 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNA2P20248 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNA2P20248 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNA2P20248 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNA2P20248 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNA2P20248 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNA2P20248 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNA2P20248 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNA2P20248 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNA2P20248 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNA2P20248 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNA2P20248 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNA2P20248 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNA2P20248 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNA2P20248 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNA2P20248 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNA2P20248 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNA2P20248 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNA2P20248 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNA2P20248 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNA2P20248 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNA2P20248 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNA2P20248 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCNA2P20248 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNA2P20248 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNA2P20248 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCNA2P20248 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNA2P20248 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNA2P20248 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNA2P20248 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNA2P20248 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNA2P20248 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNA2P20248 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCNA2P20248 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCNA2P20248 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNA2P20248 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNA2P20248 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNA2P20248 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNA2P20248 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNA2P20248 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNA2P20248 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNA2P20248 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNA2P20248 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNA2P20248 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNA2P20248 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNA2P20248 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA2P20248 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNA2P20248 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNA2P20248 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNA2P20248 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNA2P20248 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNA2P20248 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNA2P20248 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNA2P20248 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNA2P20248 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNA2P20248 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNA2P20248 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA2P20248 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNA2P20248 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNA2P20248 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms