Protein–RNA interactions for Protein: A8MV72

Putative UPF0607 protein ENSP00000382826, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MV72 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A8MV72 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A8MV72 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A8MV72 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A8MV72 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A8MV72 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A8MV72 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A8MV72 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A8MV72 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A8MV72 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A8MV72 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms