Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms