Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDC1Q96MU7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms