Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRRQ15256 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms