Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRRQ15256 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRRQ15256 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRRQ15256 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRRQ15256 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRRQ15256 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRRQ15256 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRRQ15256 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRRQ15256 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRRQ15256 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRRQ15256 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPRRQ15256 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPRRQ15256 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRRQ15256 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPRRQ15256 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRRQ15256 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRRQ15256 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRRQ15256 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRRQ15256 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPRRQ15256 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRRQ15256 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRRQ15256 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRRQ15256 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRRQ15256 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRRQ15256 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRRQ15256 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRRQ15256 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRRQ15256 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRRQ15256 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRRQ15256 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRRQ15256 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRRQ15256 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTPRRQ15256 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRRQ15256 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRRQ15256 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRRQ15256 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRRQ15256 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRRQ15256 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRRQ15256 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRRQ15256 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRRQ15256 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRRQ15256 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRRQ15256 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRRQ15256 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRRQ15256 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRRQ15256 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRRQ15256 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRRQ15256 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRRQ15256 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRRQ15256 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRRQ15256 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRRQ15256 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRRQ15256 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRRQ15256 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRRQ15256 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRRQ15256 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRRQ15256 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRRQ15256 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRRQ15256 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRRQ15256 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRRQ15256 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRRQ15256 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRRQ15256 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRRQ15256 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRRQ15256 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRRQ15256 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRRQ15256 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRRQ15256 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRRQ15256 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRRQ15256 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRRQ15256 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRRQ15256 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRRQ15256 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRRQ15256 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRRQ15256 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRRQ15256 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPRRQ15256 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRRQ15256 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRRQ15256 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRRQ15256 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPRRQ15256 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRRQ15256 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRRQ15256 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRRQ15256 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRRQ15256 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRRQ15256 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRRQ15256 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRRQ15256 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRRQ15256 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRRQ15256 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRRQ15256 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRRQ15256 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRRQ15256 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRRQ15256 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRRQ15256 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRRQ15256 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRRQ15256 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRRQ15256 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRRQ15256 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRRQ15256 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
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