RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN11-201ENST00000064724 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.34■■■□□ 2.13
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CLDN11-201ENST00000064724 SMARCA2P51531 1590 aa27.61■■■□□ 2.01
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CLDN11-201ENST00000064724 SOGA1O94964 1423 aa27.16■■□□□ 1.94
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CLDN11-201ENST00000064724 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.06■■□□□ 1.92
CLDN11-201ENST00000064724 CEP162Q5TB80 1403 aa27■■□□□ 1.91
CLDN11-201ENST00000064724 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27■■□□□ 1.91
CLDN11-201ENST00000064724 SYNJ1O43426 1573 aa26.91■■□□□ 1.9
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CLDN11-201ENST00000064724 PRXQ9BXM0 1461 aa26.4■■□□□ 1.82
CLDN11-201ENST00000064724 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.4■■□□□ 1.82
CLDN11-201ENST00000064724 KIF27Q86VH2 1401 aa26.28■■□□□ 1.8
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CLDN11-201ENST00000064724 PRDM2Q13029 1718 aa26.2■■□□□ 1.78
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CLDN11-201ENST00000064724 ARAP1Q96P48 1450 aa26.15■■□□□ 1.78
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CLDN11-201ENST00000064724 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.02■■□□□ 1.76
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CLDN11-201ENST00000064724 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.94■■□□□ 1.74
CLDN11-201ENST00000064724 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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CLDN11-201ENST00000064724 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
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CLDN11-201ENST00000064724 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.77■■□□□ 1.72
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CLDN11-201ENST00000064724 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.69■■□□□ 1.7
CLDN11-201ENST00000064724 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CLDN11-201ENST00000064724 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.65■■□□□ 1.7
CLDN11-201ENST00000064724 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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CLDN11-201ENST00000064724 NESP48681 1621 aa25.64■■□□□ 1.7
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CLDN11-201ENST00000064724 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.59■■□□□ 1.69
CLDN11-201ENST00000064724 NEUROD1Q13562 356 aa25.57■■□□□ 1.68
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.56■■□□□ 1.68
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