Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBRQ0VD83 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms