Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
APOBRQ0VD83 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
APOBRQ0VD83 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
APOBRQ0VD83 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
APOBRQ0VD83 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
APOBRQ0VD83 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
APOBRQ0VD83 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
APOBRQ0VD83 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
APOBRQ0VD83 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
APOBRQ0VD83 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
APOBRQ0VD83 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
APOBRQ0VD83 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
APOBRQ0VD83 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
APOBRQ0VD83 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
APOBRQ0VD83 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
APOBRQ0VD83 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
APOBRQ0VD83 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
APOBRQ0VD83 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
APOBRQ0VD83 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
APOBRQ0VD83 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
APOBRQ0VD83 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
APOBRQ0VD83 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
APOBRQ0VD83 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
APOBRQ0VD83 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
APOBRQ0VD83 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
APOBRQ0VD83 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
APOBRQ0VD83 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
APOBRQ0VD83 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
APOBRQ0VD83 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
APOBRQ0VD83 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
APOBRQ0VD83 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
APOBRQ0VD83 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
APOBRQ0VD83 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
APOBRQ0VD83 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
APOBRQ0VD83 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
APOBRQ0VD83 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
APOBRQ0VD83 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
APOBRQ0VD83 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
APOBRQ0VD83 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
APOBRQ0VD83 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
APOBRQ0VD83 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
APOBRQ0VD83 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
APOBRQ0VD83 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
APOBRQ0VD83 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
APOBRQ0VD83 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
APOBRQ0VD83 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
APOBRQ0VD83 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
APOBRQ0VD83 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
APOBRQ0VD83 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
APOBRQ0VD83 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
APOBRQ0VD83 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
APOBRQ0VD83 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
APOBRQ0VD83 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
APOBRQ0VD83 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
APOBRQ0VD83 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
APOBRQ0VD83 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
APOBRQ0VD83 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
APOBRQ0VD83 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
APOBRQ0VD83 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
APOBRQ0VD83 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
APOBRQ0VD83 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
APOBRQ0VD83 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
APOBRQ0VD83 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
APOBRQ0VD83 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
APOBRQ0VD83 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
APOBRQ0VD83 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
APOBRQ0VD83 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
APOBRQ0VD83 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
APOBRQ0VD83 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
APOBRQ0VD83 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
APOBRQ0VD83 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
APOBRQ0VD83 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
APOBRQ0VD83 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
APOBRQ0VD83 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
APOBRQ0VD83 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
APOBRQ0VD83 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
APOBRQ0VD83 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
APOBRQ0VD83 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
APOBRQ0VD83 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
APOBRQ0VD83 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
APOBRQ0VD83 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
APOBRQ0VD83 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
APOBRQ0VD83 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
APOBRQ0VD83 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
APOBRQ0VD83 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
APOBRQ0VD83 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
APOBRQ0VD83 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
APOBRQ0VD83 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
APOBRQ0VD83 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
APOBRQ0VD83 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
APOBRQ0VD83 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
APOBRQ0VD83 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
APOBRQ0VD83 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
APOBRQ0VD83 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
APOBRQ0VD83 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
APOBRQ0VD83 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
APOBRQ0VD83 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
APOBRQ0VD83 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
APOBRQ0VD83 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
APOBRQ0VD83 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms