Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KNL1-203ENST00000526913 5584 ntTSL 1 (best)1.88□□□□□ -2.112e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DAB2-207ENST00000507539 931 ntTSL 511.83□□□□□ -0.525e-8■■■■■ 149
UTP3Q9NQZ2 OTUD5-207ENST00000484499 924 ntTSL 510.01□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 149
UTP3Q9NQZ2 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 220.84■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 216.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.738e-7■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.758e-7■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.668e-7■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 FADS1-210ENST00000496123 693 ntTSL 510.98□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 FADS1-213ENST00000539999 405 ntTSL 37.6□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 148.9
UTP3Q9NQZ2 BRD4-210ENST00000601941 604 ntTSL 513.2□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.015e-8■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 29.25□□□□□ -0.935e-8■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-222ENST00000591333 557 ntTSL 416.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-213ENST00000587956 512 ntTSL 515.03■□□□□ -02e-6■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 SPPL3-208ENST00000543854 508 ntTSL 520.35■□□□□ 0.858e-7■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 SPPL3-207ENST00000543608 636 ntTSL 317.33■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 SPPL3-204ENST00000536996 763 ntTSL 515.41■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 317.96■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 148.8
UTP3Q9NQZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 SLC9A3R2-209ENST00000567504 578 ntTSL 317.11■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.717e-7■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 SGTA-204ENST00000589251 637 ntTSL 314.15□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -16e-7■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 148.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.198e-12■■■■■ 148.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM62-203ENST00000564494 2025 ntTSL 1 (best)11.88□□□□□ -0.518e-12■■■■■ 148.6
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-209ENST00000488299 1620 ntTSL 218.64■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 148.6
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 148.6
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 148.6
UTP3Q9NQZ2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 148.6
UTP3Q9NQZ2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.577e-12■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 FBXO22-207ENST00000569022 2164 ntTSL 1 (best)18.83■□□□□ 0.619e-8■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 FBXO22-205ENST00000565036 725 ntTSL 518.72■□□□□ 0.599e-8■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 FBXO22-209ENST00000569749 1496 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.399e-8■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.339e-8■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.449e-7■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.425e-7■■■■■ 148.5
UTP3Q9NQZ2 POLR3E-214ENST00000565358 565 ntTSL 420.97■□□□□ 0.954e-8■■■■■ 148.4
UTP3Q9NQZ2 POLR3E-205ENST00000563024 473 ntTSL 420.97■□□□□ 0.954e-8■■■■■ 148.4
UTP3Q9NQZ2 RGL2-245ENST00000491168 2316 ntTSL 218.31■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.54e-8■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 RGL2-243ENST00000483151 2772 ntTSL 215.94■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 RGL2-238ENST00000437840 2687 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 57.62□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-211ENST00000482302 984 ntTSL 320.69■□□□□ 0.96e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-207ENST00000470968 867 ntTSL 519.71■□□□□ 0.756e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-203ENST00000464204 1034 ntTSL 1 (best)16.4■□□□□ 0.226e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-212ENST00000487209 828 ntTSL 215.69■□□□□ 0.16e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.16e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-214ENST00000497050 973 ntTSL 214.62□□□□□ -0.076e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.146e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-215ENST00000497569 830 ntTSL 313.84□□□□□ -0.196e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-204ENST00000465321 726 ntTSL 513.67□□□□□ -0.226e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-213ENST00000496932 779 ntTSL 313.58□□□□□ -0.246e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-210ENST00000479686 417 ntTSL 313.42□□□□□ -0.266e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.346e-15■■■■■ 148.3
UTP3Q9NQZ2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 BCAT1-209ENST00000546285 549 ntTSL 46.36□□□□□ -1.394e-10■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 TBL1XR1-222ENST00000631253 4186 ntTSL 52.8□□□□□ -1.969e-7■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 528.04■■■□□ 2.089e-10■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 KTN1-221ENST00000555498 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.13■□□□□ 0.979e-10■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 KTN1-225ENST00000557267 291 ntTSL 38.44□□□□□ -1.069e-10■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.519e-10■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.969e-10■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.48□□□□□ -2.019e-10■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.129e-10■■■■■ 148.2
UTP3Q9NQZ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.434e-7■■■■■ 148.1
UTP3Q9NQZ2 AC104041.1-202ENST00000560097 566 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 148
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-204ENST00000593515 1664 ntTSL 517.45■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 148
UTP3Q9NQZ2 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 217.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 148
UTP3Q9NQZ2 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 516.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 148
UTP3Q9NQZ2 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 148
UTP3Q9NQZ2 BLCAP-207ENST00000414080 581 ntTSL 323.31■■□□□ 1.326e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 BLCAP-210ENST00000445723 588 ntTSL 419.86■□□□□ 0.776e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC13.01□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 TOP2B-202ENST00000413971 2049 ntTSL 55.45□□□□□ -1.541e-21■■■■■ 147.8
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