RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497569.5

ELOVL1-215, Transcript of ELOVL fatty acid elongase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ELOVL1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOVL1-215ENST00000497569 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.61■■■□□ 2.81
ELOVL1-215ENST00000497569 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.27■■■□□ 2.28
ELOVL1-215ENST00000497569 ABCC9O60706 1549 aa29.02■■■□□ 2.24
ELOVL1-215ENST00000497569 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.8■■■□□ 2.04
ELOVL1-215ENST00000497569 NACADO15069 1562 aa27.65■■■□□ 2.02
ELOVL1-215ENST00000497569 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.38■■□□□ 1.97
ELOVL1-215ENST00000497569 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.35■■□□□ 1.97
ELOVL1-215ENST00000497569 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
ELOVL1-215ENST00000497569 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.04■■□□□ 1.92
ELOVL1-215ENST00000497569 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.01■■□□□ 1.91
ELOVL1-215ENST00000497569 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27■■□□□ 1.91
ELOVL1-215ENST00000497569 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
ELOVL1-215ENST00000497569 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.88■■□□□ 1.89
ELOVL1-215ENST00000497569 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.77■■□□□ 1.88
ELOVL1-215ENST00000497569 SCRIBQ14160 1630 aa26.57■■□□□ 1.84
ELOVL1-215ENST00000497569 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
ELOVL1-215ENST00000497569 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.25■■□□□ 1.79
ELOVL1-215ENST00000497569 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.19■■□□□ 1.78
ELOVL1-215ENST00000497569 NCAPD3P42695 1498 aa25.5■■□□□ 1.67
ELOVL1-215ENST00000497569 SMARCA2P51531 1590 aa25.41■■□□□ 1.66
ELOVL1-215ENST00000497569 SMARCA4P51532 1647 aa25.4■■□□□ 1.66
ELOVL1-215ENST00000497569 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.4■■□□□ 1.66
ELOVL1-215ENST00000497569 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ELOVL1-215ENST00000497569 HMGXB3Q12766 1538 aa25.36■■□□□ 1.65
ELOVL1-215ENST00000497569 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.22■■□□□ 1.63
ELOVL1-215ENST00000497569 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ELOVL1-215ENST00000497569 ERCC6Q03468 1493 aa25.14■■□□□ 1.61
ELOVL1-215ENST00000497569 CUX2O14529 1486 aa25.1■■□□□ 1.61
ELOVL1-215ENST00000497569 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.06■■□□□ 1.6
ELOVL1-215ENST00000497569 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.93■■□□□ 1.58
ELOVL1-215ENST00000497569 NESP48681 1621 aa24.93■■□□□ 1.58
ELOVL1-215ENST00000497569 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.84■■□□□ 1.57
ELOVL1-215ENST00000497569 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.79■■□□□ 1.56
ELOVL1-215ENST00000497569 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ELOVL1-215ENST00000497569 WIZO95785 1651 aa24.74■■□□□ 1.55
ELOVL1-215ENST00000497569 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.71■■□□□ 1.55
ELOVL1-215ENST00000497569 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.63■■□□□ 1.53
ELOVL1-215ENST00000497569 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ELOVL1-215ENST00000497569 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ELOVL1-215ENST00000497569 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.53■■□□□ 1.52
ELOVL1-215ENST00000497569 WDR62O43379 1518 aa24.47■■□□□ 1.51
ELOVL1-215ENST00000497569 CFTRP13569 1480 aa24.47■■□□□ 1.51
ELOVL1-215ENST00000497569 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.47■■□□□ 1.51
ELOVL1-215ENST00000497569 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.43■■□□□ 1.5
ELOVL1-215ENST00000497569 PRDM2Q13029 1718 aa24.21■■□□□ 1.47
ELOVL1-215ENST00000497569 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.19■■□□□ 1.46
ELOVL1-215ENST00000497569 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ELOVL1-215ENST00000497569 ABCC8Q09428 1581 aa24.03■■□□□ 1.44
ELOVL1-215ENST00000497569 IFT140Q96RY7 1462 aa23.99■■□□□ 1.43
ELOVL1-215ENST00000497569 TOPBP1Q92547 1522 aa23.96■■□□□ 1.43
ELOVL1-215ENST00000497569 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.91■■□□□ 1.42
ELOVL1-215ENST00000497569 OSCARQ8IYS5 282 aa23.91■■□□□ 1.42
ELOVL1-215ENST00000497569 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ELOVL1-215ENST00000497569 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
ELOVL1-215ENST00000497569 TRIM41Q8WV44 630 aa23.74■■□□□ 1.39
ELOVL1-215ENST00000497569 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
ELOVL1-215ENST00000497569 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
ELOVL1-215ENST00000497569 WDR97A6NE52 1622 aa23.64■■□□□ 1.38
ELOVL1-215ENST00000497569 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
ELOVL1-215ENST00000497569 SOGA1O94964 1423 aa23.61■■□□□ 1.37
ELOVL1-215ENST00000497569 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.59■■□□□ 1.37
ELOVL1-215ENST00000497569 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.56■■□□□ 1.36
ELOVL1-215ENST00000497569 CUX1P39880 1505 aa23.56■■□□□ 1.36
ELOVL1-215ENST00000497569 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.54■■□□□ 1.36
ELOVL1-215ENST00000497569 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.54■■□□□ 1.36
ELOVL1-215ENST00000497569 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.54■■□□□ 1.36
ELOVL1-215ENST00000497569 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ELOVL1-215ENST00000497569 ARHGEF11O15085 1522 aa23.52■■□□□ 1.36
ELOVL1-215ENST00000497569 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ELOVL1-215ENST00000497569 CHD1O14646 1710 aa23.5■■□□□ 1.35
ELOVL1-215ENST00000497569 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ELOVL1-215ENST00000497569 FBLN2P98095 1184 aa23.46■■□□□ 1.35
ELOVL1-215ENST00000497569 GRIN2BQ13224 1484 aa23.44■■□□□ 1.34
ELOVL1-215ENST00000497569 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.44■■□□□ 1.34
ELOVL1-215ENST00000497569 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.37■■□□□ 1.33
ELOVL1-215ENST00000497569 SYNJ2O15056 1496 aa23.36■■□□□ 1.33
ELOVL1-215ENST00000497569 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ELOVL1-215ENST00000497569 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.35■■□□□ 1.33
ELOVL1-215ENST00000497569 SYNJ1O43426 1573 aa23.35■■□□□ 1.33
ELOVL1-215ENST00000497569 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.32
ELOVL1-215ENST00000497569 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.31■■□□□ 1.32
ELOVL1-215ENST00000497569 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.3■■□□□ 1.32
ELOVL1-215ENST00000497569 PBRM1Q86U86 1689 aa23.29■■□□□ 1.32
ELOVL1-215ENST00000497569 TOP2BQ02880 1626 aa23.27■■□□□ 1.32
ELOVL1-215ENST00000497569 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.27■■□□□ 1.32
ELOVL1-215ENST00000497569 ARAP1Q96P48 1450 aa23.27■■□□□ 1.32
ELOVL1-215ENST00000497569 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.26■■□□□ 1.31
ELOVL1-215ENST00000497569 ADAMTS12P58397 1594 aa23.13■■□□□ 1.29
ELOVL1-215ENST00000497569 GRIN2AQ12879 1464 aa23.12■■□□□ 1.29
ELOVL1-215ENST00000497569 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.11■■□□□ 1.29
ELOVL1-215ENST00000497569 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.08■■□□□ 1.29
ELOVL1-215ENST00000497569 NUP160Q12769 1436 aa23.05■■□□□ 1.28
ELOVL1-215ENST00000497569 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ELOVL1-215ENST00000497569 CEP170Q5SW79 1584 aa22.99■■□□□ 1.27
ELOVL1-215ENST00000497569 SHROOM2Q13796 1616 aa22.92■■□□□ 1.26
ELOVL1-215ENST00000497569 KIF27Q86VH2 1401 aa22.85■■□□□ 1.25
ELOVL1-215ENST00000497569 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.84■■□□□ 1.25
ELOVL1-215ENST00000497569 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.81■■□□□ 1.24
ELOVL1-215ENST00000497569 CUL7Q14999 1698 aa22.8■■□□□ 1.24
ELOVL1-215ENST00000497569 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms