Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V9GYV3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
V9GYV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V9GYV3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V9GYV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V9GYV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V9GYV3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V9GYV3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
V9GYV3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
V9GYV3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
V9GYV3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
V9GYV3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYV3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYV3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYV3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYV3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
V9GYV3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V9GYV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYV3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V9GYV3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYV3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYV3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYV3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYV3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYV3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V9GYV3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYV3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYV3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYV3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYV3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V9GYV3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
V9GYV3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYV3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYV3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYV3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYV3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYV3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYV3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYV3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYV3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYV3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYV3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYV3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYV3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYV3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYV3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms