Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-216ENST00000518462 621 ntTSL 419.24■□□□□ 0.675e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.525e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.445e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 517.47■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 517.08■□□□□ 0.321e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.325e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.325e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 415.69■□□□□ 0.15e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 TCF25-221ENST00000568409 857 ntTSL 315.03■□□□□ -01e-8■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 RNF213-216ENST00000573548 616 ntTSL 214.49□□□□□ -0.095e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.245e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-211ENST00000486714 824 ntTSL 513.56□□□□□ -0.245e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 RNF213-207ENST00000559070 4644 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.415e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 TCF25-206ENST00000562193 627 ntTSL 311.27□□□□□ -0.611e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-204ENST00000422355 562 ntTSL 210.46□□□□□ -0.735e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.875e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-212ENST00000487455 464 ntTSL 49.36□□□□□ -0.915e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.965e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.035e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.045e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.045e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-209ENST00000442614 869 ntTSL 28.2□□□□□ -1.15e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-207ENST00000434230 899 ntTSL 28□□□□□ -1.135e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.145e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-202ENST00000418819 849 ntTSL 36.56□□□□□ -1.365e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-214ENST00000492116 582 ntTSL 26.38□□□□□ -1.395e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.425e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 525.05■■□□□ 1.63e-7■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)24.97■■□□□ 1.593e-7■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.513e-7■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.493e-7■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.473e-7■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 218.81■□□□□ 0.63e-7■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EZH2-210ENST00000498186 1876 ntTSL 227.08■■□□□ 1.931e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EZH2-207ENST00000483012 1491 ntTSL 226.99■■□□□ 1.911e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.811e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.581e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.051e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 218.03■□□□□ 0.481e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.081e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ARHGEF40-202ENST00000553709 5204 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ARHGEF40-207ENST00000556399 4902 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ARHGEF40-206ENST00000555232 3902 ntTSL 213.57□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 318.55■□□□□ 0.565e-9■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 01e-6■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 325.75■■□□□ 1.715e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.365e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 318.22■□□□□ 0.515e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 217.28■□□□□ 0.365e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.215e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 512□□□□□ -0.495e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.545e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.615e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.85e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.865e-24■■□□□ 12.3
UTP18Q9Y5J1 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 319.67■□□□□ 0.743e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 318.89■□□□□ 0.613e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 217.4■□□□□ 0.383e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 517.18■□□□□ 0.343e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 515.92■□□□□ 0.143e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.183e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 512.98□□□□□ -0.333e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.353e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.433e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 312.22□□□□□ -0.453e-10■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 FASN-207ENST00000635197 627 ntTSL 316.62■□□□□ 0.252e-7■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.1□□□□□ -1.596e-54■■□□□ 12.2
UTP18Q9Y5J1 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 317.09■□□□□ 0.332e-8■■□□□ 12.1
UTP18Q9Y5J1 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-8■■□□□ 12.1
UTP18Q9Y5J1 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-8■■□□□ 12.1
UTP18Q9Y5J1 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-8■■□□□ 12.1
UTP18Q9Y5J1 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-8■■□□□ 12.1
UTP18Q9Y5J1 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.612e-8■■□□□ 12.1
UTP18Q9Y5J1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.233e-8■■□□□ 12.1
UTP18Q9Y5J1 H2AFX-201ENST00000375167 1373 ntTSL 217.37■□□□□ 0.373e-8■■□□□ 12.1
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 222.69■■□□□ 1.224e-7■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 214.65□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.722e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.632e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-214ENST00000486311 473 ntTSL 323.33■■□□□ 1.332e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 LYL1-203ENST00000590974 902 ntTSL 323.09■■□□□ 1.292e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-223ENST00000590215 749 ntTSL 520.06■□□□□ 0.82e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 219.76■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-212ENST00000478616 882 ntTSL 519.76■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-213ENST00000485080 1230 ntTSL 518.96■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 SREBF1-218ENST00000578469 588 ntTSL 318.59■□□□□ 0.572e-6■■□□□ 12
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