Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPA1Q9UND3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPIPA1Q9UND3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NPIPA1Q9UND3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NPIPA1Q9UND3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms