Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DENND2AQ9ULE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DENND2AQ9ULE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms