Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPUSD1Q9UJJ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPUSD1Q9UJJ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms