Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS51Q9UID3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS51Q9UID3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS51Q9UID3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms