Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRFN1Q9P244 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN1Q9P244 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN1Q9P244 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms