Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
C9orf78Q9NZ63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
C9orf78Q9NZ63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
C9orf78Q9NZ63 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
C9orf78Q9NZ63 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
C9orf78Q9NZ63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
C9orf78Q9NZ63 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
C9orf78Q9NZ63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
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