Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CWC25Q9NXE8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CWC25Q9NXE8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CWC25Q9NXE8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CWC25Q9NXE8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms