Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDH12Q9NPG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH12Q9NPG4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH12Q9NPG4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms