Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPCPD1Q9NPB8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPCPD1Q9NPB8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPCPD1Q9NPB8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms