Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VTA1Q9NP79 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VTA1Q9NP79 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VTA1Q9NP79 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms