Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ERVK-5Q9HDB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERVK-5Q9HDB9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERVK-5Q9HDB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-5Q9HDB9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms