Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KIAA1549Q9HCM3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KIAA1549Q9HCM3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549Q9HCM3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms