Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK4Q9HAZ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK4Q9HAZ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms