Protein–RNA interactions for Protein: Q9H741

C12orf49, UPF0454 protein C12orf49, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf49Q9H741 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C12orf49Q9H741 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C12orf49Q9H741 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf49Q9H741 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms