Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCAD1Q9H4L7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMARCAD1Q9H4L7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMARCAD1Q9H4L7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCAD1Q9H4L7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMARCAD1Q9H4L7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCAD1Q9H4L7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCAD1Q9H4L7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms