Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3FQ9H1D9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR3FQ9H1D9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR3FQ9H1D9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms