Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP3Q9BQQ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RTP3Q9BQQ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP3Q9BQQ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms