Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPENQ96T58 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPENQ96T58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPENQ96T58 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPENQ96T58 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPENQ96T58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPENQ96T58 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPENQ96T58 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPENQ96T58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPENQ96T58 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms