Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ1

SIGLEC12, Sialic acid-binding Ig-like lectin 12, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGLEC12Q96PQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIGLEC12Q96PQ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIGLEC12Q96PQ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIGLEC12Q96PQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIGLEC12Q96PQ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms