Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC41A2Q96JW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC41A2Q96JW4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A2Q96JW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms