Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLMNQ96JQ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLMNQ96JQ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLMNQ96JQ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLMNQ96JQ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLMNQ96JQ2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 655.9 ms