Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWCEQ96DN2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWCEQ96DN2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VWCEQ96DN2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWCEQ96DN2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms